在新建日光溫室過程中，后墻用土量大，多年耕作的富含有機質的表層土大多被取走，加之新建時采用機械作業，土壤結構遭到破壞逐漸變為堅實的無結構狀態。而蔬菜生產需要有機質豐富(4%-6%之間)、質地沙黏適中、團粒結構好、土層深厚、酸堿度適宜、土質比較疏松、不易板結、透氣的土壤。因此新建的日光溫室要注重土壤改良，通過土壤耕作和增加土壤有機質，以宜于蔬菜栽培。
1、結合耕作增施有機肥使肥土相融：
由于在新建日光溫室過程中富含有機質的表層土大多被取走，故此新建溫室首要的問題是增加土壤中的有機質含量。土壤有機質具有提供作物所需要的養分和提高養分的有效性，改善土壤的理化性狀，增強土壤的保肥性能和緩沖性能。新建溫室最好主要以施用含木質素、纖維素多的有機肥，如牛糞、羊糞和作物秸稈等，每畝有機肥施用量應在0.5萬-1萬公斤左右。而不能以施用含速效性養分多且分解快的雞糞、豬糞等肥料為主，因此類肥料含木質素、纖維素較少，對土壤腐殖質形成作用不大。
2、土壤耕作：
通過深挖曬垡，對土壤耕層和地面進行翻、松、碎、平作業，以加深耕層，改善土壤結構，調節土壤中水、肥、氣、熱等因素存在狀況，使土壤耕層疏松，增加土壤總孔隙和非毛細管孔隙，從而增加土壤的通氣性和容水量。通過耕作，把因機械壓力遭到破壞逐漸變為堅實的無結構狀態的土層翻下去，把下層具有較好結構性的土壤翻上來，恢復土壤耕層和團粒結構。
